Datée de la fin du XIIème, elle est attribuée par la tradition à la famille de Gui Foulques qui devint pape en 1265 sous le nom de Clément IV. Elle abrite aujourd’hui des salles de Musée: salle d’archéologie, salle d’ornithologie, salle d’ethnologie.

Sa construction commencera à la fin du XIème siècle. Longue de 50m et large de 25m, c’est une vaste église basse divisée en trois nefs, capable de recevoir des foules de pèlerins venant prier sur le tombeau de Saint-Gilles. La Crypte est restée aujourd’hui, comme au Moyen-âge, le centre du culte à Saint-Gilles; elle renferme en effet le sarcophage du Saint, redécouvert en 1865 par l’Abbé Goubler, et porte l’inscription : IN HTML QI C B AEGD (dans ce tombeau repose le corps du bienheureux AEGIDIUS). Sur la voûte d’arête à caisson qui surplombe le tombeau se trouvent des traces d’une préparation de fresques, malheureusement très effacées. Il faut aussi remarquer dans le collatéral sud du plan incliné dit « escalier des Abbés », construit en 1220 et reliant les deux églises ; le tombeau du légat du Pape Innocent III, Pierre de Castelnau , qui fut assassiné en 1208 et dont l’assassinat servira de prétexte à la Croisade contre les Albigeois ; un puits dont l’intérieur est magnifiquement appareillé.

L'église supérieure fut partiellement détruite lors des Guerres de Religion (1562-1622) et, en 1650, seule la moitié de l'église sera réparée;les voûtes seront largement rabaissées (18m au lieu de 25m pour la nef centrale).
Les bases de support seules subsistent. Le seul mur partiellement conservé en élévation est celui du bas côté nord, dont le décor et la structure sont très semblables à ceux que l'on trouve sur la façade occidentale.
Au centre du Choeur semi-circulaire se trouve une table d'autel posée sur un chapiteau corinthien que surmonte une colonne cannelée sur laquelle on a fixé le buste moderne de Clément IV, natif de Saint-Gilles.
Dans le déambulatoire s'ordonnent des sarcophages gallo-romains portant des cartouches avec des inscriptions entourées de motifs décoratifs tels que des amours ailés ou des guirlandes de fruits.

Monuments Historiques Tél : 04.66.87.33.75 Fax : 04.66.87.16.28
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L'Abbatiale est ouverte tous les jours sauf le mercredi, dimanche et jour férié.
La Crypte, l'Escalier en Vis, le Musée de la Maison Romane et l'Ancien Choeur sont ouverts tous les jours sauf le dimanche et jour férié. En ce qui concerne les horaires d'ouverture, veuillez nous contacter.